Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc113Q8C5T8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc113Q8C5T8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms