Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ssuh2Q8C3L1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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