Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms