Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Iffo1Q8BXL9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Iffo1Q8BXL9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Iffo1Q8BXL9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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