Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmco3Q8BH01 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms