Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smndc1Q8BGT7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smndc1Q8BGT7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms