Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cpped1Q8BFS6 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cpped1Q8BFS6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms