Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Lrrc27Q80YS5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Lrrc27Q80YS5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Lrrc27Q80YS5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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