Protein–RNA interactions for Protein: Q80VU4

Ntf4, Neurotrophin-4, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf4Q80VU4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ntf4Q80VU4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ntf4Q80VU4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms