Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ0

Aldh3b1, Aldehyde dehydrogenase family 3 member B1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3b1Q80VQ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Aldh3b1Q80VQ0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms