Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clec4b1Q7TS58 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clec4b1Q7TS58 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms