Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Tnfsf18Q7TS55 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms