Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
TwistnbQ78WZ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TwistnbQ78WZ7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms