Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Vma21Q78T54 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Vma21Q78T54 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Vma21Q78T54 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Vma21Q78T54 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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