Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RfflQ6ZQM0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RfflQ6ZQM0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms