Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Topbp1Q6ZQF0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Topbp1Q6ZQF0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms