Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms