Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Med16Q6PGF3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Med16Q6PGF3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms