Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SvoplQ6PDF3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SvoplQ6PDF3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms