Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8X1

Snx6, Sorting nexin-6, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx6Q6P8X1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx6Q6P8X1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx6Q6P8X1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms