Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
VclQ64727 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
VclQ64727 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VclQ64727 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VclQ64727 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms