Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Surf4Q64310 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Surf4Q64310 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Surf4Q64310 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Surf4Q64310 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Surf4Q64310 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Surf4Q64310 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms