Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ift52Q62559 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ift52Q62559 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms