Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Itga3Q62470 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms