Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxa13Q62424 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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