Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sycp1Q62209 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms