Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Klri1-201ENSMUST00000088046 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ucp1-201ENSMUST00000034146 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669l-201ENSMUST00000103771 98 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm7972-201ENSMUST00000208434 1137 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm11292-201ENSMUST00000146121 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Zfp799-202ENSMUST00000201499 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mro-206ENSMUST00000179472 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Tac1-203ENSMUST00000184986 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cntnap2-201ENSMUST00000060839 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prm3Q62100 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms