Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Gli3Q61602 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gli3Q61602 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms