Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Dsg1aQ61495 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms