Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BcanQ61361 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcanQ61361 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BcanQ61361 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BcanQ61361 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BcanQ61361 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BcanQ61361 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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