Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Klf3Q60980 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Klf3Q60980 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms