Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
JrkQ60976 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms