Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp4Q60972 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms