Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PtprnQ60673 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PtprnQ60673 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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PtprnQ60673 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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PtprnQ60673 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PtprnQ60673 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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PtprnQ60673 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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PtprnQ60673 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PtprnQ60673 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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