Protein–RNA interactions for Protein: Q60644

Nr1h2, Oxysterols receptor LXR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h2Q60644 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nr1h2Q60644 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms