Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Slc5a6Q5U4D8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Slc5a6Q5U4D8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms