Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Specc1Q5SXY1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms