Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ankrd40Q5SUE8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms