Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam71bQ5STT6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms