Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Trappc1Q5NCF2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms