Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Defa20Q45VN2 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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