Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC030870Q3V2G4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms