Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ulk4Q3V129 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ulk4Q3V129 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms