Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
D130052B06RikQ3UW13 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms