Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Skap1Q3UUV5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Skap1Q3UUV5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms