Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms