Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam83fQ3UKU4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam83fQ3UKU4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms