Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Rnf224Q3UIW8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms