Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ccdc34Q3UI66 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms