Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmod2Q3UHZ5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms